全基因組測(cè)序

樣本類型

樣本要求

保存及運(yùn)輸條件

說(shuō)明內(nèi)容

新鮮組織

1.新鮮組織標(biāo)本（腫瘤樣本在術(shù)后 30分鐘內(nèi)取得）≥50mg（黃豆粒大?。?，-80℃直接長(zhǎng)期凍存，-20℃可保存2-3個(gè)月。

2.穿刺樣本：腫瘤組織長(zhǎng)度≥1 cm，2-3條；所有新鮮組織標(biāo)本要求未壞死腫瘤組織比例在70%以上；必須首先進(jìn)行常規(guī)病理診斷，可于-80℃直接長(zhǎng)期凍存，-20℃可保存2-3個(gè)月 。

干冰運(yùn)輸

白片/蠟卷

1.切片厚度3-5 μm，5-10張（組織≥1×1 cm² ）或10-20張（組織＜1×1 cm²）切片；白片置于切片盒中。

2.蠟卷：直接置于1.5 mL無(wú)菌離心管中。

常溫保存和運(yùn)輸

蠟卷應(yīng)保證組織含量充足；盡量送檢一年以內(nèi)的石蠟標(biāo)本。

外周血（DNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL靜脈血，4℃保存，4-6小時(shí)內(nèi)分離血漿，分離后血漿不少于2 mL。

2.Streck管采集樣本：4-5 mL靜脈血，常溫可存儲(chǔ)72 h，分離后血漿不少于2 mL。

1.EDTA 抗凝管采集的血液，經(jīng)分離血漿后，48 h內(nèi)送達(dá)，可使用足量冰袋，用泡沫箱運(yùn)輸；超過(guò)48 h，使用干冰運(yùn)輸。2.Streck管采集的血液，72 h內(nèi)送達(dá)，常溫運(yùn)輸，注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取或-80℃暫存。

外周血（cfDNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL靜脈血；4℃保存，4-6小時(shí)內(nèi)分離血漿，分離后血漿不少于原體積一半；分離后的血漿在-20℃冰箱最多可保存一周。

2.Streck管：4-5 mL靜脈血，分離后血漿不少于原體積一半，常溫可存儲(chǔ)72 h。

1.EDTA抗凝管采集的血液，經(jīng)分離血漿后，48 h內(nèi)送達(dá)，可使用足量冰袋，用泡沫箱運(yùn)輸；超過(guò)48 h，使用干冰運(yùn)輸。2.Streck管采集的血液，72 h內(nèi)送達(dá)，常溫運(yùn)輸，注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取。

gDNA

基因組DNA用TE溶解；總量≥500 ng （采用HiSeq X平臺(tái)）或≥2 μg （采用HiSeq2000/2500平臺(tái)）；純度OD_260/280在1.8-2.0之間；濃度≥50 ng/μL。DNA完整無(wú)降解，無(wú) RNA、蛋白質(zhì)等污染。

使用 1.5 mL或2 mL離心管盛放，用parafilm封口膜密封，然后將樣本管置于保護(hù)用的50 mL離心管或其他類似容器里，并旋緊蓋子。使用足量冰袋，用泡沫箱運(yùn)輸。

某些種類植物DNA 樣本需要專門去除多糖。